Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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