Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA4CQ9C0C4 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms