Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 SNRPEP5-201ENST00000425442 278 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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