Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 USP2-AS1-203ENST00000530002 764 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AP003119.1-201ENST00000533437 538 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 PTPRJ-AS1-201ENST00000533964 301 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AP001880.1-201ENST00000538772 421 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC025423.3-201ENST00000541551 469 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC004801.5-201ENST00000552958 550 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ISCA2-202ENST00000554924 489 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL133371.3-201ENST00000556197 549 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC078905.1-201ENST00000560803 509 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MRPL45P2-203ENST00000573318 473 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MIR4519-201ENST00000579767 58 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC090376.1-202ENST00000587276 470 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ZNF83-209ENST00000596930 560 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC015574.1-201ENST00000615194 489 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC000041.2-201ENST00000619824 151 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC079801.1-201ENST00000623753 388 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC01206-231ENST00000629026 858 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC009971.1-201ENST00000634253 673 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 PIGN-225ENST00000638435 4382 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 IL18RAP-202ENST00000409369 1890 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ACTR3BP2-201ENST00000413404 1373 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 NFYC-211ENST00000427410 1379 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 MTCP1-201ENST00000362018 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 HBS1L-202ENST00000367820 638 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 C1orf61-204ENST00000368243 879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL035467.1-201ENST00000403583 686 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ZNF70P1-201ENST00000417480 624 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RPL7L1P12-201ENST00000417594 729 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 GRM7-AS2-201ENST00000427748 520 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AP000474.1-201ENST00000441465 680 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC002064.1-201ENST00000445784 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL355472.1-201ENST00000451795 575 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC007690.1-201ENST00000451924 468 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 MCHR2-AS1-204ENST00000452482 821 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 SLC17A1-203ENST00000468082 1242 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC068531.1-201ENST00000502398 195 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CC2D2A-205ENST00000503658 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms