Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 NAA25-201ENST00000261745 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 FAM186A-201ENST00000327337 7127 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
COL24A1Q17RW2 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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COL24A1Q17RW2 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
COL24A1Q17RW2 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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