Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CLDND1-205ENST00000502288 560 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC078950.1-201ENST00000538349 550 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 TMEM55A-206ENST00000630164 171 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AMD1-201ENST00000368876 3040 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL035467.1-201ENST00000403583 686 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC132192.1-201ENST00000531111 597 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 ZNF473-209ENST00000601364 603 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTF1Q16619 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms