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| FXN | Q16595 | RN7SL382P-201 | ENST00000482631 | 282 nt | BASIC | 6.4 | □□□□□ -1.38 | | |
| FXN | Q16595 | CYB5A-204 | ENST00000494131 | 776 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.4 | □□□□□ -1.38 | | |
| FXN | Q16595 | HSPE1P23-201 | ENST00000509838 | 286 nt | BASIC | 6.4 | □□□□□ -1.38 | | |
| FXN | Q16595 | AC016559.1-201 | ENST00000511420 | 199 nt | BASIC | 6.4 | □□□□□ -1.38 | | |
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| FXN | Q16595 | IFIT1-202 | ENST00000546318 | 4613 nt | TSL 3 BASIC | 6.4 | □□□□□ -1.39 | | |
| FXN | Q16595 | ATP5S-202 | ENST00000311459 | 10212 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.4 | □□□□□ -1.39 | | |
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| FXN | Q16595 | ADGRE1-203 | ENST00000381404 | 3056 nt | TSL 2 BASIC | 6.39 | □□□□□ -1.39 | | |
| FXN | Q16595 | LMO3-202 | ENST00000320122 | 3759 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.39 | □□□□□ -1.39 | | |
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| FXN | Q16595 | ZNF410-211 | ENST00000555044 | 2601 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.39 | □□□□□ -1.39 | | |
| FXN | Q16595 | SLC2A14-203 | ENST00000431042 | 3458 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 6.39 | □□□□□ -1.39 | | |
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| FXN | Q16595 | TC2N-202 | ENST00000360594 | 3751 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.39 | □□□□□ -1.39 | | |
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| FXN | Q16595 | AC005832.1-201 | ENST00000544380 | 572 nt | TSL 4 BASIC | 6.39 | □□□□□ -1.39 | | |
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| FXN | Q16595 | RN7SL697P-201 | ENST00000582484 | 299 nt | BASIC | 6.39 | □□□□□ -1.39 | | |
| FXN | Q16595 | AC011447.3-202 | ENST00000593655 | 555 nt | TSL 4 BASIC | 6.39 | □□□□□ -1.39 | | |
| FXN | Q16595 | SOX9-AS1-216 | ENST00000602213 | 821 nt | TSL 5 BASIC | 6.39 | □□□□□ -1.39 | | |