Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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