Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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SYCP1Q15431 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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SYCP1Q15431 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SYCP1Q15431 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
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