Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC097467.3-215ENST00000609486 793 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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