Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RUNX3Q13761 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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