Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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CDH18Q13634 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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CDH18Q13634 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CDH18Q13634 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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