Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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CUL4AQ13619 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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CUL4AQ13619 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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CUL4AQ13619 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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CUL4AQ13619 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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CUL4AQ13619 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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CUL4AQ13619 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CUL4AQ13619 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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