Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM3BP58499 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms