Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CENPFP49454 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CENPFP49454 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CENPFP49454 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CENPFP49454 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CENPFP49454 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CENPFP49454 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CENPFP49454 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CENPFP49454 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CENPFP49454 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CENPFP49454 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CENPFP49454 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CENPFP49454 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CENPFP49454 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CENPFP49454 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CENPFP49454 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CENPFP49454 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CENPFP49454 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CENPFP49454 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CENPFP49454 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CENPFP49454 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CENPFP49454 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CENPFP49454 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CENPFP49454 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 CASP12-212ENST00000613512 1451 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 ZNF518A-201ENST00000316045 7277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 PTPN3-204ENST00000446349 8630 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CENPFP49454 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 EYA4-206ENST00000431403 2154 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 MYOF-201ENST00000358334 6680 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 WDR87-202ENST00000447313 9009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CENPFP49454 CEP63-202ENST00000337090 5632 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CENPFP49454 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms