Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms