Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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SH3BP4Q9P0V3 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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SH3BP4Q9P0V3 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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SH3BP4Q9P0V3 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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SH3BP4Q9P0V3 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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SH3BP4Q9P0V3 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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