Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 TTC33-207ENST00000637375 1824 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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UBXN4Q92575 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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UBXN4Q92575 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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UBXN4Q92575 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
UBXN4Q92575 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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