Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC068620.2-201ENST00000602927 529 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC005291.2-201ENST00000609088 523 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MIR6831-201ENST00000617240 81 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC024580.2-201ENST00000623363 231 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC109826.1-203ENST00000624259 1105 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC012593.1-216ENST00000626183 444 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SGO1-AS1-206ENST00000635369 442 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ABCC9-207ENST00000636888 1023 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 DCLRE1C-209ENST00000378278 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC01427-202ENST00000635258 4566 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RAD21L1-203ENST00000409241 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 PSG5-201ENST00000342951 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL357556.1-201ENST00000421884 1388 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 PIGN-221ENST00000638183 4046 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 CSAG4-201ENST00000361201 755 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SETDB1-203ENST00000368963 1045 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SSX9-201ENST00000376909 591 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SPINK4-202ENST00000379725 533 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 TRAV29DV5-201ENST00000390458 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SNORA77.1-201ENST00000408156 125 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP8-201ENST00000411037 358 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP172-201ENST00000411341 298 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC01238-201ENST00000416204 590 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL139184.1-201ENST00000426579 364 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 FAM133B-202ENST00000427372 931 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC006450.2-201ENST00000429482 581 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL591806.1-201ENST00000447167 1109 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 IFNWP9-201ENST00000448683 591 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC013264.1-201ENST00000449346 455 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC104451.1-201ENST00000458010 176 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RN7SL150P-201ENST00000462298 262 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 HINT1P1-201ENST00000464866 378 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 CASQ1-202ENST00000467691 595 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC009022.1-201ENST00000472115 496 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC100843.1-201ENST00000475372 550 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RPL14P3-201ENST00000476715 622 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 IGKV1-12-201ENST00000480492 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 GGTA1P-204ENST00000488429 1104 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AF250324.1-204ENST00000501825 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC021106.2-201ENST00000505310 710 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC02365-203ENST00000522554 802 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC00958-203ENST00000527945 1121 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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