Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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GRIK4Q16099 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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GRIK4Q16099 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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GRIK4Q16099 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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GRIK4Q16099 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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GRIK4Q16099 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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GRIK4Q16099 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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GRIK4Q16099 C11orf54-202ENST00000354421 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
GRIK4Q16099 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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