Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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VPS72Q15906 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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VPS72Q15906 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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VPS72Q15906 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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