Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MTFR2-205ENST00000451457 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 BBX-207ENST00000416476 2178 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LINC01706-201ENST00000455299 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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