Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
EFNB3Q15768 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.8 ms