Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1AQ15573 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms