Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PUM3Q15397 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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