Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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