Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL1Q13616 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.5 ms