Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SP140Q13342 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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SP140Q13342 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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