Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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TRAF1Q13077 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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TRAF1Q13077 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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TRAF1Q13077 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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TRAF1Q13077 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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TRAF1Q13077 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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TRAF1Q13077 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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TRAF1Q13077 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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TRAF1Q13077 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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TRAF1Q13077 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAF1Q13077 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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