Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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FOXF2Q12947 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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FOXF2Q12947 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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FOXF2Q12947 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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