Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 GAPDHP69-201ENST00000425504 1008 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL355102.4-201ENST00000553638 738 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC015969.1-201ENST00000366218 1416 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CHRNEQ04844 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms