Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ACADSBP45954 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms