Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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PTPRMP28827 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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PTPRMP28827 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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PTPRMP28827 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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PTPRMP28827 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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PTPRMP28827 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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PTPRMP28827 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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PTPRMP28827 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
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PTPRMP28827 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
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PTPRMP28827 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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PTPRMP28827 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 TTC3P1-201ENST00000399586 6081 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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