Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NMBRP28336 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NMBRP28336 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NMBRP28336 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NMBRP28336 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NMBRP28336 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NMBRP28336 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NMBRP28336 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NMBRP28336 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NMBRP28336 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NMBRP28336 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NMBRP28336 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms