Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ABLIM3-201ENST00000309868 4326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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