Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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EHD3Q9NZN3 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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EHD3Q9NZN3 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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EHD3Q9NZN3 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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EHD3Q9NZN3 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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EHD3Q9NZN3 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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EHD3Q9NZN3 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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EHD3Q9NZN3 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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