Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
IMPG1Q17R60 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms