Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
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VPS72Q15906 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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VPS72Q15906 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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VPS72Q15906 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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