Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FHL3Q13643 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms