Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NME3Q13232 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NME3Q13232 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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NME3Q13232 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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NME3Q13232 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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NME3Q13232 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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NME3Q13232 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NME3Q13232 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NME3Q13232 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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