Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 CDRT8-201ENST00000579752 467 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 CCDC15-203ENST00000529051 3924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 SERPINA6-201ENST00000341584 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 TXNRD1-219ENST00000529546 2018 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CASP10-201ENST00000272879 2073 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 MAP3K7CL-202ENST00000339024 2066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 MAP3K7CL-208ENST00000399935 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 LINC01206-202ENST00000474045 2240 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 MAPK10-260ENST00000641047 2546 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 PIEZO2-204ENST00000538948 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 TXNRD1-208ENST00000525566 3836 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 GIGYF2-201ENST00000373563 5847 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 PAIP2B-201ENST00000244221 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 WDR87-202ENST00000447313 9009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 KIF23-201ENST00000260363 3713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 STON2-201ENST00000267540 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 BCO2-201ENST00000357685 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 MRPL30-201ENST00000338148 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 SLAMF7-207ENST00000458602 2449 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ARL6IP5-201ENST00000273258 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 HEPACAM2-203ENST00000440868 2060 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 SHQ1-203ENST00000463369 2065 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 LINC01258-201ENST00000512517 2059 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RASSF6-201ENST00000307439 5994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CENPL-201ENST00000345664 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 WWC3-AS1-201ENST00000430057 578 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RN7SL55P-201ENST00000464534 297 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RPSAP48-201ENST00000466509 889 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AAMDC-203ENST00000525034 511 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 TIMM9-205ENST00000555404 430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL390058.1-201ENST00000603834 629 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXC1Q12948 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms