Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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FOXF2Q12947 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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FOXF2Q12947 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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FOXF2Q12947 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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FOXF2Q12947 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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FOXF2Q12947 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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