Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TIAM2-208ENST00000461783 6981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 SCAF11-205ENST00000465950 5296 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 ADGRF5-202ENST00000283296 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 UTY-214ENST00000617789 6682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 WDR7-213ENST00000615645 5257 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 IKZF3-203ENST00000346872 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms