Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
IFFO1Q0D2I5 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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