Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRX1P78414 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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