Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AP3M2P53677 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
AP3M2P53677 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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