Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 TAF1L-201ENST00000242310 6216 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 KCNMA1-273ENST00000639913 12071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CENPFP49454 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AL355916.1-202ENST00000508827 5103 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 POLR3A-201ENST00000372371 6640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CENPFP49454 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CENPFP49454 OR8G1-202ENST00000641972 5055 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CENPFP49454 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CENPFP49454 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CENPFP49454 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CENPFP49454 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CENPFP49454 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms