Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CASQ1P31415 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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CASQ1P31415 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CASQ1P31415 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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