Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 PAIP2B-201ENST00000244221 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 HMCN2-206ENST00000624552 15610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 OR5AU1-202ENST00000641039 8232 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRMP28827 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms