Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
CCDC93Q567U6 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms